Holobionte, médiation chimique et bioprotection

Holobionte, médiation chimique et bioprotectionLa deuxième question scientifique s'articule autour de l'holobionte, de la médiation chimique et de la bioprotection

L’holobionte est défini comme étant un super-organisme associant un hôte et son microbiote, lequel représente l’ensemble des microorganismes à l’état libre ou organisés en biofilm. Si l’existence d’un microbiote associé est désormais bien documentée et acceptée par la communauté scientifique, les interactions moléculaires permettant le contrôle du microbiote et son rôle dans l’homéostasie des macroorganismes marins restent encore obscurs.

Nos principaux objectifs sont de:

• Dresser l’inventaire du microbiote associé aux macroorganismes marins (Holothurie, macroalgues proliférantes, bactéries…) par des techniques de metabarcoding
• Identifier, à partir du microbiote cultivable, des souches bactériennes présentant des activités antimicrobiennes et/ou anti-biofilm dirigées contre les bactéries pathogènes marines
• Explorer et exploiter l’arsenal de médiation chimique de l’hôte et du microbiote par des analyses métabolomiques et par la recherche d’activités anti-biofilm, antibactériennes, anti-oxydantes et antivirales.

Au niveau moléculaire, nous nous intéressons à la caractérisation structurale des composés bioactifs originaux produits, à leurs mécanismes d’action, à leurs voies de biosynthèse et à la régulation de leur production.

Différents modèles sont étudiés des macroalgues proliférantes (Ulva, Sargassum et Solieria), des microalgues, des bactéries marines dont celles du genre Pseudoalteromonas.

Quelques publications de référence

Offret C., Rochard V., Laguerre H., Mounier J., Huchette S., Brillet B., Le chevalier P., Fleury Y. 2019. Protective Efficacy of a Pseudoalteromonas Strain in European Abalone, Haliotis tuberculata, Infected with Vibrio harveyi ORM4. Probiotics and Antimicrobial Proteins 11(1), 239-247.

Jouault A., Gobet A., Simon M., Portier E., Perennou M., Corre E., Gaillard F., Vallenet D., Michel G., Fleury Y., Bazire A. and Dufour A. 2020. Alterocin, an antibiofilm protein secreted by Pseudoalteromonas sp. 3J6. Applied Environmental Microbiology. 86(23). (IF 3.96).

Abdul Malik S.A., Bedoux G., Robledo D., Garcia Maldonado J.Q., Freile-Pelegrín Y.,  Bourgougnon N. 2020. Chemical defence by allelopathic active metabolites of Halymenia floresii (Rhodophyta) against biofouling. Journal Applied in Phycology, 10.1007/s10811-020-02094-4.

Doghri I., Brian-Jaisson F., Graber M., Bazire A., Dufour A., Bellon-fontaine M. N., Herry J. M., Ferro A. C., Sopena V., Lanneluc I., and Sable S. 2020. Antibiofilm activity in the culture supernatant of a marine Peudomonas sp. Bacterium. Microbiology 166, 239-252.